Eugène Rutembesa est diplômé de l'Université Saint Denis (Paris 8) en psychologie clinique et psychopathologie. Depuis 2004, il mène des recherches sur la résilience auprès des survivants du génocide de 1994 contre les Tutsi au Rwanda. Il a été (2010) vice-président du Forum international des chercheurs intéressés par la résilience à travers les cultures.  

Depuis 2006, il assure la supervision et la formation de professionnels rwandais travaillant dans des associations locales et des ONG internationales. 

Depuis 1997, Eugène Rutembesa travaille comme psychologue clinicien et ethno-psychiatre. Après 1994, il s'intéresse davantage au traitement des traumatismes et à la résilience des survivants du génocide au Rwanda.